só uma coisa, o windows pode reconhecer a partição do linux, só tens de instalar
este software.
Deixo é o aviso que isso é perigoso porque essa driver não reconheçe permissões logo TUDO é alteravel... Recomendo vivamente que a partição que contem o grub (boot loader) não esteja disponivel ao windows sequer.
A minha sugestão é que uses o disco SATA2 como disco para os SO's e o dividas em 4 partes: uma partição windows, uma partição para a /home do linux, uma partição para o sistema proprio sistema linux e uma partição swap. É a forma como eu tenho formatado os meus discos e tem-me ajudado bastante em alturas de format. Outra ideia é pegar no teu disco mais pequeno e usa-lo como partição /home do linux. As possibilidades são imensas.